Please use this identifier to cite or link to this item: https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/30155
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.creatorFerreira, Giulia Magalhães-
dc.date.accessioned2020-10-21T13:50:50Z-
dc.date.available2020-10-21T13:50:50Z-
dc.date.issued2020-10-01-
dc.identifier.citationFERREIRA, Giulia Magalhães. Análise da variabilidade genômica de SARS-CoV-2 circulantes no estado de Minas Gerais. 2020. 88 f. Dissertação (Mestrado em Imunologia e Parasitologia Aplicadas) - Universidade Federal de Uberlândia. Uberlândia, 2020. DOI http://doi.org/10.14393/ufu.di.2020.661pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufu.br/handle/123456789/30155-
dc.description.abstractThe severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) was first identified in Wuhan-China, as the causative agent of the coronavirus disease 2019 (COVID-19). Since notified in São Paulo on 26th February 2020, more than 3,000,000 cases and 106,000 deaths were reported in Brazil. In the early epidemic phase, SARSCoV-2 spread locally, however, over time, this virus was disseminated to other regions of the country. Here we performed genome sequencing and phylogenetic analysis of SARSCoV-2 of 20 clinical samples of COVID-19 confirmed cases from 9 cities of MG, in order to evaluate the genetic characterization of circulating viral strains in the state from March to May 2020. Our analyses demonstrated the circulation of B.1 lineage isolates in the investigated locations and nucleotide substitutions were observed into the genomic regions related to important viral structures. Additionally, sequences generated in this study clustered with isolates from Sao Paulo state, suggesting a dissemination route between these 2 states. Alternatively, monophyletic groups of sequences from MG and other states or country were observed, indicating independent events of virus introduction. These results reinforce the need of genomic surveillance for understand the ongoing spread of the emerging viral pathogens.pt_BR
dc.description.sponsorshipCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorpt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Uberlândiapt_BR
dc.rightsAcesso Embargadopt_BR
dc.subjectSARS-CoV-2pt_BR
dc.subjectCOVID-19pt_BR
dc.subjectGenomic surveillancept_BR
dc.subjectMinas Geraispt_BR
dc.subjectGenome sequencept_BR
dc.subjectB1 lineagept_BR
dc.subjectvigilância genômicapt_BR
dc.subjectSequenciamento genômicopt_BR
dc.subjectLinhagem B1pt_BR
dc.titleAnálise da variabilidade genômica de SARS-CoV-2 circulantes no estado de Minas Geraispt_BR
dc.title.alternative“Analysis of the genomic variability of SARS-CoV-2 circulating in the state of Minas Gerais ”pt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/7294839440557548pt_BR
dc.contributor.advisor1Jardim, Ana Carolina Gomes-
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/7960921685798643pt_BR
dc.contributor.referee1Royer, Sabrina-
dc.contributor.referee2Machado, Alex Martins-
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/6522135001572733pt_BR
dc.description.degreenameDissertação (Mestrado)pt_BR
dc.description.resumoO coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2) foi identificado pela primeira vez em Wuhan-China, como o agente causador da doença do coronavírus 2019 (COVID-19). Desde o surgimento do primeiro caso em São Paulo, em 26 de fevereiro de 2020, mais de 3.000.000 de casos e 106.000 mortes foram notificados no Brasil. Na fase inicial da epidemia, o SARS-CoV-2 se espalhou localmente, no entanto, com o tempo, esse vírus se disseminou para outras regiões do país. Neste estudo, o sequenciamento do genoma do SARS-CoV-2 e análises filogenéticas foram realizados a partir de sequencias obtidas do processamento de 20 amostras clínicas com diagnóstico para COVID-19, provenientes de 9 cidades de MG, a fim de avaliar a caracterização genética das variantes virais circulantes no estado, de março a maio de 2020. As análises demonstraram a circulação da linhagem B.1 nos locais investigados e substituições nucleotídicas foram observadas nas regiões genômicas relacionadas a importantes estruturas virais. Além disso, as sequências geradas neste estudo agrupam filogeneticamente com isolados do estado de São Paulo, sugerindo uma rota de transmissão entre esses 2 estados. Alternativamente, grupos monofiléticos de sequências de MG e de outros estados ou país foram observados, indicando eventos de introdução independente do vírus. Esses resultados reforçam a necessidade de vigilância genômica para o entendimento da atual propagação de patógenos virais emergentespt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Imunologia e Parasitologia Aplicadaspt_BR
dc.sizeorduration88pt_BR
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOSpt_BR
dc.identifier.doihttp://doi.org/10.14393/ufu.di.2020.661pt_BR
dc.crossref.doibatchid834c9b56-b0d8-4401-96c1-e5769e6f047e-
dc.subject.autorizadoImunologiapt_BR
Appears in Collections:DISSERTAÇÃO - Imunologia e Parasitologia Aplicadas

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
AnáliseVariabilidadeGenômica.pdf13 MBAdobe PDFThumbnail
View/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.